学会邀请钟声教授前来提供咨询服务

2009年1月7日上午9:00,在上海市钦州路100号1号楼12楼的大会议室,上海市生物信息学会偕同上海生物信息技术研究中心联合邀请钟声教授前来围绕主题:“Gene regulatory network in embryonic stem cell” 为大家提供生物信息学的咨询服务。

钟声,2001年毕业于北京大学数学系,2005年哈佛生物统计博士,2005年UIUC生物工程系助理研究员。在系统生物学方面,已有七年的研究经历,并且主要集中在真核转录方面的研究。在转录调控方面的研究有着很广泛的范围,包括设计基因组实验和发展统计学方法来研究1)通过分析基因表达,ChIP-chip和多基因组序列数据鉴定TFBSs和转录网络;2)基因表达时相和大规模基因knockout数据的功能分析;3)跨实验室和跨物种的基因表达数据分析;4)应用工程学原理研究ESCs的调控原理。本项目承担者在斯坦福大学和伊利诺伊大学的工作中,关于利用多物种数据进行的GRN鉴定的研究取得了两个重大成功。第一,他及其研究组发展了一个精确的统计学系统,将不同实验室和不同物种的基因表达数据合并到一个统一标准的分析方案中,并且从联合的数据库中提供无偏方差。这克服了长期以来,缺乏能够联合利用来源于不同实验室和不同物种数据的精确模型的困难。第二,项目承担者的研究组以热力学和动力学模型为基础,从基因表达和ChIP-chip数据中发展出一种逆向工程(reverse engineering)方法,来研究TF相互作用的规律。这种方法的基本观点是首先在调控TFs所有可能的相互作用规律下,获取靶基因转录本稳态的浓度,然后确定来自于实验观察数据的大多数相似表达模式的相互作用规律。这是第一次使多细胞真核基因组数据,特别是microarray和ChIP-chip数据能够用于转录机制的详细生物物理特点的研究。

 
 
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